报告跟踪伴随着突发公共卫生事件指挥控制的全过程，对各类可疑事件如传染病、中毒、污染等实行全程报告跟踪，直到事件被确认为结案或是解除警报。
突发事件应急预案是经过一定程序制定的处置突发事件的事先方案(预案)，是建立统一、高效、权威的突发事件应急处理体系的基础，对突发事件的应急处理要有完备的预案，包括技术上、物质上、管理上的准备和储备等，并能够得到演练的检验。公共卫生突发事件应急处理中的预案系统，包括： 各种急性传染病应急处理程序；影响区域应急处理程序；医疗物资调配应急处理程序等。
公共卫生事件应急处置系统是公共卫生应急处置的主要构成之一，当突发公共卫生事件发生时，负责现场控制、传播环节切断和事后处置等。
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