神州云专病数据库由CSDI卒中数据集成系统、用户管理系统、综合档案、心脑血管病结构化数据库构成。
CSDI卒中数据集成系统是神州云平台的数据基础，该系统以患者为中心,把分散在医院各信息系统中的患者信息数据（住院、门诊、体检）加以抽提汇总，建立一个研究型结构化云数据库。
综合档案是以卒中患者为中心，将所有相关数据集中汇总展示，形成患者的综合档案。包括来自于体检、门诊、住院、筛查、随访、绿道等数据。具备档案管理、全流程病例展示、档案检索、标签管理、生存状态管理、联系人管理、随访管理等功能。
心脑血管病结构化数据库对卒中住院患者病例进行登记，加强卒中人群的管理，促进临床科研。对非卒中入院患者进行高危人群筛查，实现主动医疗服务。同时可以自定义专病数据库，以病种为分类，创建心脑血管病结构化数据库。主要包括自定义数据库、登记库模板配置、检索、新建患者、原始档案查看、标签管理、档案登记等功能。
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